1.Crohns病 可累及胃腸道的任何部位，內鏡下見節段性全壁炎;裂隙狀潰瘍(刀切樣縱行潰瘍);非幹酪壞死性結節病樣肉芽腫。X線造影見腸黏膜的鵝卵石樣改變。腸壁因慢性炎症而增厚，引起管腔狹窄。若發生在肛管直腸部位，伴有腹瀉、腹痛、便血或便秘等，易與SRUS混淆。
2.潰瘍性結腸炎 病變呈彌漫分布，腸黏膜有多發性淺潰瘍，形體各異，大小不等，附有膿血性分泌物，黏膜充血、水腫;黏膜粗糙呈顆粒狀，質地脆，觸之易出血;可見炎性息肉。活組織學可見炎性反應，糜爛、潰瘍、隱窩膿腫、腺上皮增生及杯狀細胞減少等變化。主要症狀為腹瀉伴有黏液膿血便。
3.直腸癌 SRUS潰瘍型與BorrmannⅡ型腸癌外觀相似，前者直徑多在3.0cm以內，邊緣黏膜有彈性，光整，血管紋理清晰。後者邊界不整，質脆硬，易出血，附有汙垢苔。隆起型SRUS直徑多在2.0cm以內，邊界清，周邊黏膜質地軟，有彈性;直腸癌以隆起型多見。而直腸癌多呈不規則菜花狀，涉及範圍大，多在3.0cm以上，環繞腸壁生長，邊界不清，腸腔狹窄常見。
4.AIDS 在AIDS患者中，常可有多種消化係統症狀，主要緣於相關的胃腸道感染及腫瘤。侵及結腸者可表現腹瀉，內鏡下多為局灶性充血或有點狀出血，偶見小泡囊或糜爛，嚴重者常可見散在分布的潰瘍。腸道的卡波濟肉瘤、淋巴瘤等，也可由於瘤體所致的腸梗阻或腸道黏膜潰瘍而引起出血。HIV病原學檢測、體檢、結合病史及免疫缺陷等實驗室資料的綜合分析可明確診斷。
5.性病性淋巴肉芽腫 累及直腸時可產生潰瘍、炎症、狹窄甚至出下梗阻等症狀。病原學檢測、體檢及結合病史可以確診。
