一、實驗室檢查
1、血象檢查
白細胞總數在早期多數增加，後期常降至正常以下，中性粒細胞在80%左右，有繼發感染時更高。可有貧血。
2.糞便檢查
可發現阿米巴包囊，少數患者糞便中可找到滋養體。
3.肝功能檢查
ALT及其他項目多數正常範圍，但血清膽堿酯酶活力降低較為突出。
4.血清學檢查
應用阿米巴純培養抗原作血清學反應，其特異性甚高，如間接血凝試驗、間接熒光抗體試驗及ELISA試驗等陽性率可達95%～100%。因而對阿米巴肝膿腫有較大的輔助診斷價值，陰性者基本可以排除本病。
5.基因檢測
用溶組織內阿米巴分子量為30 × 103蛋白編碼基因引物，以PCR法可從膿液中檢測到其基因片段，敏感性和特異性均為100%。
6.診斷性肝穿刺
可抽得巧克力樣咖啡色無臭、黏稠的膿液，離心沉澱物內可能找到阿米巴滋養體，但因阿米巴多存在於膿腔壁上，陽性率較低，若將膿液按每毫升加入鏈激酶10單位，在37℃條件下，孵育30min後檢查，可提高陽性率。
二、影像檢查
1、乙狀結腸鏡檢查
可見大小不等的散在潰瘍，邊緣整齊，周圍可見紅暈，潰瘍粘膜間大多正常，自潰瘍麵刮取標本鏡檢發現病原體的機會較多。
2.X線檢查
右膈肌抬高、運動受限、局部隆起;有時可見胸膜反應或積液，右下肺炎或盤狀肺不張等;偶可見平片上顯示膿腔內有氣液麵;肝區不規則透光液氣影，則具有特殊征性診斷意義，注入造影劑可顯示膿腔大小。
3.B超、CT檢查
可判斷肝膿腫的大小、數目以及位置，但無法定性。
4.放射性核素掃描
可見肝內有占位性病變，即放射性缺損區，但直徑小於2cm的膿腫或多發性小膿腫易被漏診或誤診為轉移瘤或囊腫，因此僅對定位診斷有幫助。
