常規做血象和血生化檢查，發生腹膜炎、肺炎時有感染性血象，有白細胞增高，有血紅蛋白減少和血小板減少。血生化檢查血鈉、鉀、氯、鈣和血pH值，常有水、電解質紊亂，可出現堿中毒。可有腎功能受損表現，如肌酐升高，尿素氮升高等。
過去很多人特別強調用Farber試驗，檢查胎糞中無角化上皮細胞及胎毛以診斷腸閉鎖。對3個月以內胎兒形成腸閉鎖者有診斷價值，但對中、晚期胎兒由於機械性或血管性所致的腸閉鎖則無診斷意義，因角化上皮已下降到閉鎖遠端。近年來在臨床上已很少應用，因為根據臨床及X線檢查，確定腸閉鎖的診斷一般並不困難。另外該試驗也不完全準確。
1.X線檢查 X線腹部平片對診斷腸閉鎖和腸狹窄有很大價值。高位腸閉鎖在腹部直立位平片可顯示“三氣泡征”或大液平和小液平，即1個大液平(胃)及3～4個小液平(擴張的空腸)，下腹部則全無氣體陰影，或顯示較多的擴張腸襻。低位腸閉鎖之X線立位平片顯示多個液平及擴張之腸襻，但結腸無氣體陰影。除最遠的腸襻極度擴張外，其他擴張腸襻的口徑大多均勻一致，側位片上結腸及直腸內無氣體，此點與麻痹性腸梗阻不同。
2.X線鋇劑檢查 對腸閉鎖病兒進行鋇餐檢查是不適宜的，因有引起吸入性肺炎的危險。然而對臨床上不典型的病例，進行鋇灌腸檢查是有必要的，不但可以根據胎兒型結腸確定腸閉鎖的診斷，確定結腸有無閉鎖，而且還可以除外先天性巨結腸或腸旋轉不良。
鋇灌腸熒光屏下或攝片顯示結腸細小，直徑僅5mm左右。另外鋇灌腸可以鑒別腸回轉不良和先天性巨結腸。
腸狹窄的病例往往須行鋇餐檢查，才使診斷明確。在透視下可見鋇劑堆積在阻塞部位，僅有少量鋇劑通過狹窄段進入遠端腸腔。
3.產前作B型超聲掃描 對診斷胎兒小腸閉鎖很有價值。高位空腸閉鎖顯示從胃延伸至空腸近端有一長形液性區，或在胎兒腹腔上部探測出數個擴張的空腸液性區。
