消化道畸形嬰兒因為機型不同表現有所不同，比如胃食道反流，部分嬰兒吃奶後發生嘔吐，平常時更加明顯，嬰兒往往會有嗆咳，也有許多嬰兒是因為呼吸道感染，包括支氣管炎。
嬰兒消化係統畸形可能是因先天性消化係統閉鎖而出現，不能順利進食排便、腹脹、嘔吐等症狀。除此之外像先天性巨結腸，許多嬰兒就是便秘，出生後，便秘越來越加重趨勢，嬰兒不能自己排便，部分小孩臨床上會出現明顯腹脹，出現這種情況應及時到醫院做檢查，在醫生指導下對症治療。
在日常生活中飲食清淡為主，避免吃辛辣、刺激性食物，能良好生活習慣，保證充足睡眠。