電子腸鏡和腸鏡最大的區別是檢查部位、檢查時間、舒適度有很大的不同。
1、檢查部位不同：電子腸鏡和腸鏡都屬於比較常見的一種檢查方法，而電子腸鏡主要是通過肛門將腸鏡插入到回盲部位，而腸鏡主要是檢查小腸以外的所有腸道。
2、檢查時間不同：電子腸鏡檢查通常需要10分鍾到30分鍾左右的時間，根據個人的病情以及配合度不同，檢查的時間會存在一定的區別。而腸鏡檢查的時間大多數在20分鍾到30分鍾左右。
3、舒適度不同：這兩種檢查中電子腸鏡舒適度較高，是在無痛的情況下做檢查，引起不適的症狀會減小，而且圖像更加清晰。普通腸鏡副作用較大，會對腸胃產生刺激，舒適度不是很高。
