幹擾素這種藥物雖然說可以用來治療很多種無法根治的疾病，但是在打了幹擾素以後還是會給人們的身體造成非常大的傷害，留下來一些後遺症的，最常見的就是患者會感覺到自己的心髒功能性沒有以前那麼好的，而且自己的血液係統也會因此出現一些病變，所以說就要防止後遺症的出現。
一般副作用
1. 流感樣綜合征
在首次用IFN 治療時, 患者可出現發熱、寒顫、心率加快、肌痛、頭痛、關節痛、乏力、納差等症狀, 稱為流感樣綜合征, 是IFN 最常見的不良反應。據文獻統計, 近100% 患者出現發熱, 體溫多在38～40℃, 多發生於用藥後4～8h 內, 持續4～12h。與劑量有明顯關係, 並隨療程延長而減輕，少數患者發熱可持續2周以上。高熱的患者一定要臥床休息, 及時作降溫處理, 以物理降溫為主。症狀明顯者可給予解熱鎮痛劑，給予IFN 後2小時左右口服熱鎮痛劑可以防止熱反應出現，睡前注射IFNa可減輕副反應。
2 血液係統變化
一過性外周血細胞減少，主要表現為外周血白細胞 (中性粒細胞) 和血小板減少。白細胞減少常發生於用IFN 後數小時到數日內, IFN 引起的骨髓抑製是可逆的，部分患者用藥4周後可恢複，對於輕度白細胞、血小板減少患者同時服用利血生片或地榆升白片或血美安等可得到明顯改善，對於白細胞嚴重降低者試用粒細胞集落刺激因子 (G-CSF) 或粒細胞巨噬細胞集落刺激因子。
但在IFN 治療過程中應定期檢查血象, 限製活動, 防止受涼感冒, 注意飲食衛生, 醫護人員應嚴格無菌操作，如中性粒細胞絕對計數 ≤0.75×109/L和(或)血小板 < 50×109/L，應降低IFN-α劑量;1~2周後複查，如恢複，則逐漸增加至原量。如中性粒細胞絕對計數 ≤0.5×109/L和(或)血小板< 30×109/L，則應停藥。
3 消化係統症狀
表現為食欲不振、惡心、嘔吐, 味覺異常和肝損傷等。部分患者可出現GOT 、GPT 輕度升高。持續食欲不振會導致營養不良、抵抗力低下, 可能成為雙重感染的誘，應根據患者喜好安排飲食, 加強營養, 對於惡心嘔吐者給予胃動力藥預防。
對於長期消化道症狀不能改善者建議換用其它抗病毒藥物。對於治療過程中GOT 、GPT大於500u/l者可暫時減少IFN 用量，加強護肝降酶治療並主意病情變化，對於GOT 、GPT進行性升高伴膽紅素上升者應及時停用IFN 。
