通常，水銀溫度計的使用方法是將溫度計的金屬端置於需要測量溫度的部位，例如口腔、腋下或直腸，然後等待一段時間，直到水銀柱穩定，讀取水銀柱所指示的數值即為測量的溫度。
水銀溫度計在使用時，需要確保其金屬端與皮膚充分接觸，以獲得準確的溫度讀數。對於口腔測量，應將溫度計放在舌頭下方，緊閉嘴唇，避免說話和吞咽，等待約3分鍾；腋下測量時，應將溫度計放在腋窩深處，夾緊手臂，保持約5分鍾；直腸測量則需要在醫生指導下進行，因為不當操作可能導致損傷。此外，使用前應檢查水銀溫度計是否完好無損，避免使用破損的溫度計。
在使用水銀溫度計後，應妥善保管，避免兒童接觸，因為水銀是有毒物質。如果不慎打破，應立即通風並按照安全指南進行清理。在日常生活中，定期監測體溫是預防疾病的重要手段，如發現體溫異常，應及時就醫。