男性生殖器上長小痘痘可能是由毛囊炎、皮脂腺囊腫或生殖器皰疹等原因引起的，建議及時就醫，根據原因做針對性的改善。
1.毛囊炎：毛囊炎是由於細菌感染毛囊引起的炎症反應，表現為局部紅腫、疼痛和膿皰。治療毛囊炎可使用抗生素軟膏如紅黴素軟膏、氯黴素軟膏等外用藥物，必要時口服頭孢類抗生素如頭孢克洛、頭孢拉定等。
2.皮脂腺囊腫：皮脂腺囊腫是由於皮脂腺導管堵塞導致皮脂分泌物積聚形成的囊腫，表現為無痛性腫塊。治療皮脂腺囊腫可使用魚石脂軟膏、複方硫黃乳膏等外用藥物，必要時需手術切除。
3.生殖器皰疹：生殖器皰疹是由單純皰疹病毒感染引起的性傳播疾病，表現為局部疼痛性水皰。治療生殖器皰疹可使用抗病毒藥物如阿昔洛韋、伐昔洛韋、泛昔洛韋等，同時使用外用藥物如阿昔洛韋乳膏等。
平時注意生殖器衛生，避免不潔性行為，出現異常情況及時就醫。