通常，氟尿嘧啶軟膏用於治療皮膚癌及尖銳濕疣等皮膚疾病。它通過幹擾細胞的DNA合成，抑製腫瘤細胞的生長和繁殖。
氟尿嘧啶軟膏的作用機製主要是通過抑製胸腺嘧啶核苷酸合成酶，從而阻斷DNA的合成，對快速分裂的細胞如癌細胞和某些病毒有較強的抑製作用。此外，它還可能通過影響細胞周期的S期，減少細胞的增殖。由於其對正常細胞也有一定的影響，使用時需嚴格遵循醫囑，避免過量使用導致不良反應。
對於皮膚癌和尖銳濕疣患者，日常應避免紫外線過度照射，保持患處清潔幹燥。就醫時，應在醫生指導下使用氟尿嘧啶軟膏，不可自行盲目用藥，以免引起不必要的副作用。