沙苑子作為一種中藥材，通常被認為副作用較小。然而，任何含有活性成分的物質都有可能產生不良反應，沙苑子也不例外。在正常劑量和合理使用的情況下，沙苑子的副作用相對較輕，但個別人可能會出現輕微的胃腸道不適，如腹瀉、惡心等。
沙苑子主要含有黃酮類化合物、多糖等成分，具有補腎益精、固精止遺的功效。若與其他藥物如人參、黃芪、當歸等聯合使用，需注意藥物間的相互作用，以免影響藥效或增加不良反應。因此，在使用沙苑子時，應在醫生指導下進行，嚴格遵醫囑用藥。
使用沙苑子時，應注意個人體質差異，若出現不適症狀，應及時就醫，調整用藥方案。