部分輕症患者可能自愈，但症狀較重或免疫力低下者通常需要藥物治療。
支原體感染的病原體是支原體微生物，其自愈能力與感染部位密切相關。若感染局限於上呼吸道，且患者免疫功能正常，通過充分休息、補充營養等措施，可能在1-2周內自行恢複。但若發展為支原體肺炎，常伴隨持續咳嗽、發熱等症狀，此時病原體已侵入下呼吸道，通常需要規範抗菌治療。
患者的年齡和基礎健康狀況是重要影響因素。青壯年群體免疫係統較完善，感染後自愈概率相對較高。但對於兒童、老年人或存在慢性疾病的患者，由於免疫功能較弱，病原體容易持續繁殖並引發並發症，如中耳炎或支氣管炎等，這類人群建議盡早就醫。
當出現高熱不退、劇烈咳嗽伴胸痛、呼吸困難等重症表現時，需立即就診。醫生可能會開具大環內酯類抗生素進行治療，如阿奇黴素幹混懸劑、羅紅黴素膠囊或克拉黴素片等，這些藥物能有效抑製支原體蛋白質合成。治療期間應保持室內空氣流通，每日飲水量不少於1500ml，並避免接觸煙霧刺激。
支原體感染具有傳染性，可通過飛沫傳播。建議患者在症狀消失後繼續觀察1-2周，若出現病情反複應及時複查。日常生活中需注意保持手部衛生，在流行季節避免前往人群密集場所，均衡飲食並保證每日7-8小時睡眠，有助於增強機體抗病能力。