黃芩的別名為山茶根、土金茶根、黃文等，不同地區或文獻中可能稱其為條芩、子芩、枯芩或元芩。這些名稱主要與其形態特征、藥用部位或炮製方法相關。
1、山茶根
黃芩的根部常生長於山地或丘陵地帶，外觀與茶樹的根係有相似之處，因此得名。其根呈圓錐形，表麵黃棕色，質地堅實，是中藥材的主要使用部位。
2、土金茶根
因黃芩根部含有黃酮類化合物，幹燥後呈現金黃色斷麵，故被賦予此名。這種別稱體現了其藥用價值與外觀特征，常見於民間傳統用法中。
3、黃文
該名稱源於古代醫藥典籍的記載，可能與黃芩的藥用特性相關。其味苦性寒，歸肺、膽、脾、大腸經，具有清熱燥濕、瀉火解毒的功效。
使用黃芩時需注意其炮製方法會影響別稱及功效。例如生黃芩多用於清上焦熱，酒黃芩可增強活血作用，黃芩炭則偏於止血。建議在醫生指導下使用，避免自行配伍或超量服用，以免引起胃腸不適等不良反應。