肛門濕疹的治療方法主要包括一般治療、外用藥物、口服藥物、物理治療以及手術治療等，需根據病情嚴重程度選擇合適的方案。
1、一般治療
日常需注意保持肛門局部清潔幹燥，避免搔抓或過度清洗。選擇寬鬆透氣的棉質衣物，減少局部摩擦。飲食上應避免辛辣刺激食物，以免加重症狀。
2、外用藥物
急性期有滲出時可遵醫囑使用硼酸溶液冷濕敷，糜爛麵可外用氧化鋅軟膏保護。慢性期皮膚增厚者，可在醫生指導下短期使用氫化可的鬆乳膏、曲安奈德益康唑乳膏等糖皮質激素類藥膏，合並感染時可聯用莫匹羅星軟膏。
3、口服藥物
瘙癢劇烈者可遵醫囑服用氯雷他定片、西替利嗪片等抗組胺藥。繼發細菌感染時需口服阿莫西林膠囊、頭孢克肟片等抗生素，真菌感染需使用伊曲康唑膠囊。
4、物理治療
頑固性肛門濕疹可考慮紫外線照射、紅外線療法等物理治療，通過光熱效應促進皮膚屏障修複，但需在專業醫療機構進行操作。
5、手術治療
對於伴有嚴重肛周皮膚苔蘚化或合並肛瘺、痔瘡等肛門疾病的患者，可能需手術處理原發病灶，術後仍需配合藥物和護理。
該病易反複發作，患者需避免自行使用強效激素或偏方。若出現滲液增多、紅腫擴散或發熱等症狀，提示病情加重，應及時到皮膚科或肛腸科就診。治療期間建議每日溫水坐浴1-2次，排便後需輕柔擦拭，必要時使用醫用護臀膏隔離刺激。