金匱腎氣丸一般可以用於治療腎陽虛，但需在中醫師辨證後使用。腎虛在中醫範疇內分為腎陽虛、腎陰虛、腎氣虛等類型，不同證型的治療藥物存在差異。
1、腎陽虛
金匱腎氣丸由附子、桂枝、熟地黃等中藥組成，具有溫補腎陽的功效。對於腎陽不足引起的腰膝酸軟、畏寒肢冷、小便不利或夜尿頻多等症狀，該藥物可通過溫陽化氣改善症狀。但需注意，服用期間應避免生冷食物，以免影響藥效。
2、腎陰虛
若患者出現潮熱盜汗、五心煩熱、舌紅少苔等陰虛火旺症狀，則不宜使用該藥物。金匱腎氣丸中的附子、桂枝等溫熱藥材可能加重陰虛火旺，此時需選用六味地黃丸、左歸丸等滋陰類藥物。
3、其他腎虛類型
對於腎氣虛引起的倦怠乏力、氣短自汗，或腎精不足導致的發育遲緩、生殖功能減退等情況，建議選用金鎖固精丸、五子衍宗丸等針對性藥物。腎虛證型複雜，單一藥物無法覆蓋所有類型。
使用金匱腎氣丸前需經中醫師四診合參明確證型，患者不可自行判斷用藥。服藥期間出現口幹舌燥、大便幹燥等不適時應及時停用並就診。日常應注意節製房事，適當進行八段錦、太極拳等舒緩運動以輔助調理。