陰莖上長小疙瘩可能是由於皮膚炎症、感染或者性傳播疾病等原因引起的，通常需要針對具體原因進行處理。一般的方法主要有生活調理、物理治療和藥物治療等，一般需根據具體情況進行選擇。
1.生活調理
首先要保持局部的清潔和幹燥，避免使用刺激性的清潔用品。同時，要避免過度的性行為和手淫，以免加重症狀。此外，飲食上要清淡，避免辛辣、油膩等刺激性食物，多吃蔬菜水果，保持大便通暢。
2.物理治療
如果疙瘩較小，可以嚐試使用冷敷或者熱敷的方法，以緩解局部的炎症和腫脹。但要注意溫度適中，避免燙傷皮膚。此外，還可以嚐試使用紫外線照射等物理療法，以促進局部血液循環，加速疙瘩的消退。
3.藥物治療
如果疙瘩較大或者伴有疼痛、瘙癢等症狀，可以在醫生指導下使用一些外用藥物，如酮康唑、克黴唑、特比萘芬等抗真菌藥物，以抑製真菌感染。如果疙瘩伴有紅腫、疼痛等炎症表現，可以使用紅黴素、氯黴素、四環素等抗生素軟膏，以控製局部感染。如果疙瘩是由性傳播疾病引起的，如尖銳濕疣、生殖器皰疹等，需要在醫生指導下使用抗病毒藥物，如阿昔洛韋、伐昔洛韋、泛昔洛韋等。
陰莖上長小疙瘩的原因多樣，如果疙瘩持續存在或者症狀加重，建議及時就醫，明確診斷，對症治療。同時，要注意個人衛生，避免不潔性行為，以減少感染的風險。