雙側基底節腔梗能不能自愈，不能一概而論。如果病情比較輕微，一般能自愈，如果病情比較嚴重，一般不能自愈。如果出現了雙側基底節腔梗，建議到醫院進行檢查，明確具體病因後，在醫生指導下進行針對性治療。
雙側基底節腔梗主要是由於小血管閉塞所致，主要發生在大腦深部的白質、基底核、丘腦、腦橋等部位，如果患者本身病情比較輕微，沒有出現明顯不適症狀，並且疾病沒有影響到大腦功能，此時一般可以逐漸自愈。
如果患者病情比較嚴重，腔隙性腦幹梗塞對腦供血狀況影響較大，且影響到了腦幹部位和大腦功能，還伴隨出現了頭痛、暈厥等症狀，此時一般不能自愈，需要及時治療。
在日常生活當中，建議患者多觀察自身症狀，定期到醫院進行身體檢查，幫助查看疾病恢複情況。同時也應多注意休息，避免長時間熬夜或進行劇烈運動，以免身體過度疲勞，影響到疾病恢複。