腳趾甲長黑點的原因比較多，多數是因為不注意導致指甲受傷，這時候會出現血管破裂引起淤血的情況。除此以外也可能和營養不良，缺乏微量元素有關，如果還出現瘙癢等症狀，那麼很可能和真菌感染有關。另外也不排除甲母痣，也就是黑色素瘤的因素。
1、腳指甲損傷引起
如果患者有劇烈的運動，或者有重物的撞擊，可能是導致了腳趾的血管細微破裂，後期就會出現腳趾的淤血，可以回憶一下有無疼痛的感覺，盡量不要穿鞋麵窄的鞋子，可以局部熱敷改善這種情況。
2、營養不良缺乏微量元素
如果患者有長期營養不良的病史的話，出現腳趾黑點也可能與微量元素缺乏有關，建議可以先觀察，改變不良的生活方式。
3、真菌感染如灰指甲的原因
指甲黑點也有可能是與灰指甲有關，如果患者有不潔的生活史，如亂穿他人鞋子等，可能感染了人類乳頭瘤病毒，就會出現這種現象，還會伴有指甲發硬、發脆的症狀。
4、甲母痣
也會出現黑點，但是黑點一般會連到甲的根部。還有可能是黑色素瘤，如果是黑色素瘤，需要及時的使用顯微鏡或者皮膚鏡檢查，盡早的確診。