腎結石疼痛在腰部、輸尿管、膀胱，甚至還會造成睾丸部位出現疼痛，疼痛的時間可以長達15分鍾到數小時，多數在深夜以及淩晨發作。
1、腰部疼痛：腎結石是平時生活中常見的一種腎髒疾病，當體內的腎結石體積不是很大的時候，會造成形狀不規則的小石頭，在腎盂輸尿管部位逐漸在移動，但是在移動的過程當中，也會對患者自身的腎盂輸尿管造成一定的損傷，從而誘發腰部疼痛症狀。
2、輸尿管疼痛：腎結石在身體內會逐漸的移動，當這些小結石移動到尿道部位，會對尿道組織造成一定損傷，短時間內可能會引起輸尿管疼痛的症狀。
3、膀胱疼痛：腎結石患者如果沒有及時進行治療，結石體積逐漸增大，這樣會對泌尿係統造成一定的損傷，會出現感染的症狀，甚至也會堵塞膀胱和尿道口，引起疼痛的症狀。
4、睾丸疼痛：腎結石的患者體內的結石會慢慢的移動，如果掉到輸卵管或者是尿道部位，會引起局部出現阻塞或者是堵塞，造成疼痛感，這些疼痛也會直接放射到睾丸部位，引起睾丸疼痛症狀。