排卵期同房後兩天小腹隱隱作痛可能是正常現象，也可能是動作過於粗暴、盆腔炎、宮頸炎、子宮肌瘤等其他原因造成的，應及時到醫院就診，明確病因後，在醫生指導下進行針對性治療。
1、正常現象
排卵期間體內激素水平發生變化，可能會導致少量子宮內膜脫落，出現少量出血、小腹隱隱作痛等症狀，屬於正常現象，一般不需要特殊治療。
2、動作過於粗暴
同房可能會對女性的腹部造成一定的刺激，出現小腹隱隱作痛的情況，可以使用熱水袋適當熱敷5分鍾~10分鍾，起到緩解的作用。
3、盆腔炎
平時不注意個人衛生，細菌進入盆腔組織可能會誘發盆腔炎，患者在同房後兩天會出現小腹隱隱作痛的情況，通常還會伴有陰道分泌物異常增多的症狀，需在醫生指導下使用阿莫西林膠囊、鹽酸左氧氟沙星膠囊等藥物進行治療，能夠起到消炎殺菌的作用。
4、宮頸炎
可能與激素、免疫、感染等多種因素有關，如果患有該疾病，患者在排卵期同房後可能會對宮頸部位造成一定的刺激，使患者出現小腹隱隱作痛的情況。需遵醫囑使用甲硝唑片、鹽酸克林黴素膠囊等藥物進行治療，減輕炎症反應。
5、子宮肌瘤
是子宮平滑肌組織增生形成的良性腫瘤，可能與遺傳、激素、幹細胞有關。瘤體增大，同房後可能會導致患者出現上述情況。必要時需在醫生指導下通過肌瘤切除術和子宮切除術等手術方式進行治療，能夠起到一定的治療效果。
在日常生活中，患者需要注意個人衛生，避免不健康的性生活，貼身衣物勤換勤洗，每晚可以使用40℃的溫水清洗外陰部位。