肛瘺是由肛竇線感染、肛周膿腫潰破造成的。 如果肛瘺形成的軌道不再繼續發展，病情相對穩定。 對於體質比較差的人，長期的慢性炎症容易出現癌變。 對一些瘺管來說，一般不會出現癌變，癌變雖是個例，但建議盡早到醫院治療。
