治療胃間質瘤必須注意首次治療的效果。首次治療必須精準的發現並切除腫瘤，如果手術順利，療效就會明顯的提高。病患就會有54%的機會達到5年的生存率。如果第一次沒有達到最好的治療效果，那可能隻有10%的5年生存率。目前治療胃間質瘤除了可以采用傳統的治療方法外，還可以選擇生物免疫治療、這種方法會減少放化療給病患帶來的痛苦，有效的延長病患的生病周期和質量！
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