肛周疣一般不會自愈。它們是由人乳頭瘤病毒（HPV）引起的，這種病毒在體內可以長期存在，導致疣體持續生長。雖然免疫係統在某些情況下可能會清除病毒，但這個過程通常需要時間，並且不能保證疣體會完全消失。
在治療肛周疣時，醫生可能會推薦使用藥物療法，例如塗抹咪喹莫特乳膏、使用咪喹莫特莫德凝膠或塗抹酸類藥物如水楊酸。這些藥物可以幫助刺激免疫係統對病毒的反應，促進疣體的消退。然而，使用這些藥物需要在醫生的指導下進行，因為它們可能會引起皮膚刺激或其他副作用。
對於肛周疣的治療，建議及時就醫，遵循醫生的建議進行治療。同時，保持良好的個人衛生習慣，避免與他人共用毛巾或衣物，可以減少病毒傳播的風險。