HPV感染通常可以通過人體的免疫係統自然清除，但某些類型的HPV感染可能導致長期的宮頸病變，甚至宮頸癌。治療HPV感染的目標是管理症狀和預防並發症，而不是直接消滅病毒。
HPV感染的治療通常取決於感染的類型和個體的健康狀況。例如，對於輕度的感染，可能不需要特殊治療，因為大多數HPV感染會在一到兩年內自行消退。然而，對於高危HPV類型引起的宮頸病變，可能需要進行更積極的治療，如液氮冷凍治療、激光治療或LEEP手術。此外，對於生殖器疣，可以使用藥物如咪喹莫特、波多菲洛和西多福韋等進行治療，這些藥物應在醫生的指導下使用，以確保安全和有效。
對於HPV感染，重要的是定期進行篩查，特別是對於宮頸癌的預防。接種HPV疫苗也是預防感染的有效手段。如果出現症狀或有感染風險，應及時谘詢醫生並遵循醫囑進行治療。