使用衝牙器對牙齒通常有好處，它可以幫助清潔牙縫和牙齦線，減少牙菌斑和食物殘渣的積累，預防牙周病和蛀牙。然而，衝牙器的使用需要適當，過度使用或不當操作可能會對牙齦造成刺激或損傷。
衝牙器通過高壓水流清潔牙齒，對於難以用牙刷清潔的區域尤其有效。例如，牙線難以到達的牙縫深處、牙齒矯正器周圍或種植牙的周圍區域，使用衝牙器可以更有效地清除細菌和食物殘渣。常見的衝牙器配合使用的藥物包括複方氯己定含漱液、氟化鈉牙膏和碳酸氫鈉溶液，這些藥物可以在醫生指導下使用，以增強口腔衛生的維護效果。
使用衝牙器時，應遵循產品說明和醫生的建議，以確保安全有效。對於牙齦敏感或有特殊口腔狀況的人群，使用前最好谘詢牙科醫生。