指甲蓋凹凸不平有小坑可能是營養不良、外傷或真菌感染等原因引起的，建議及時就醫，根據原因做針對性的改善。
1.營養不良：指甲凹凸不平可能是由於缺乏維生素A、維生素C或鋅等微量元素造成的。治療方法包括補充相應的維生素和微量元素，如口服維生素A軟膠囊、維生素C片和鋅片。
2.外傷：指甲受到外力撞擊或壓迫，可能導致指甲蓋出現凹凸不平的現象。這種情況下，一般不需要特殊治療，隨著指甲的生長，受損部分會逐漸被新長出的指甲替代。
3.真菌感染：指甲凹凸不平也可能是由真菌感染引起的，如甲癬。治療方法包括使用抗真菌藥物，如酮康唑乳膏、特比萘芬噴霧劑和伊曲康唑膠囊等，應在醫生指導下使用。
除以上原因外，還可能與長期接觸化學物質、慢性疾病等因素有關。建議保持指甲清潔幹燥，避免長時間浸泡在水中，定期修剪指甲，避免使用刺激性強的化學物質。如症狀持續不改善，應及時就醫，以免延誤病情。