口腔潰瘍通常可以自愈，但這個過程可能需要幾天到幾周不等。大多數情況下，輕微的口腔潰瘍不需要特別的治療，通過保持口腔衛生，避免食用辛辣、硬質食物的刺激，以及充足的休息，身體自身的修複能力足以促進愈合。然而，如果潰瘍麵積較大或持續時間較長，可能需要醫療幹預。
在某些情況下，口腔潰瘍可能由缺乏維生素、礦物質或某些藥物的副作用引起。例如，缺乏維生素B群、鐵或鋅可能導致口腔潰瘍。此外，一些藥物如非甾體抗炎藥（如布洛芬）、某些抗生素（如四環素）和免疫抑製劑（如環孢素）也可能引起口腔潰瘍。在這些情況下，應在醫生的指導下調整飲食或更換藥物。
如果口腔潰瘍頻繁發生或伴隨其他症狀，應及時就醫。醫生可能會建議使用局部治療，如含有苯佐卡因的凝膠或含有地塞米鬆的貼片來緩解疼痛和促進愈合。重要的是，任何藥物的使用都應在醫生的指導下進行，以確保安全和效果。