通常，適量食用芥末一般不會引起明顯的副作用。芥末含有異硫氰酸酯等成分，具有辛辣味，可能會刺激口腔和鼻腔黏膜，引起短暫的不適感。部分人可能對芥末過敏，食用後出現皮膚瘙癢、紅腫等過敏反應。此外，芥末具有促進消化、增進食欲的作用，但過量食用可能刺激胃腸道，引起腹痛、腹瀉等不適。
長期過量食用芥末，可能對胃腸道黏膜造成刺激和損傷，增加胃炎、胃潰瘍等消化係統疾病的風險。此外，芥末中的辛辣成分可能加重痔瘡、肛裂等肛腸疾病的病情。建議適量食用芥末，避免過量。如出現過敏反應或消化係統不適，應及時就醫，在醫生指導下調整飲食結構和用藥。