通常，口腔潰瘍的治療可以通過多種藥物來緩解症狀和促進愈合。這些藥物包括局部止痛藥、抗炎藥、抗菌藥和促進愈合的藥膏等。
對於輕度的口腔潰瘍，一般可以使用含有苯佐卡因的局部止痛藥來減輕疼痛感。若口腔潰瘍伴有炎症反應，可以使用含有地塞米鬆的抗炎藥膏來減輕炎症。在潰瘍部位出現感染跡象時，可以使用含有氯己定的抗菌漱口水來減少細菌。對於較難愈合的潰瘍，可能需要使用含有生長因子的藥膏來促進愈合。
針對口腔潰瘍，日常建議保持口腔衛生，避免辛辣刺激性食物，並確保充足的維生素攝入。若潰瘍長時間不愈合或頻繁複發，應及時就醫，在醫生指導下用藥，不可自行盲目用藥。