皮蛋通常不建議生吃。皮蛋在製作過程中可能會受到細菌汙染，尤其是沙門氏菌，生吃存在一定的食品安全風險。此外，皮蛋中的蛋白質在未經過加熱處理時，其結構較為緊密，不利於人體消化吸收。
在食用皮蛋時，建議先進行加熱處理，以確保食品安全和提高營養價值。加熱可以采用蒸、煮或炒的方式，這樣不僅能夠殺死可能存在的細菌，還能使蛋白質結構鬆散，更易於消化。例如，可以製作皮蛋瘦肉粥、皮蛋豆腐湯或皮蛋拌豆腐等美味佳肴。在準備這些菜肴時，可以選擇使用生薑、大蒜和醋等調料，以增加風味並有助於殺菌。
為了健康考慮，食用皮蛋前最好進行適當的烹飪處理，並確保食材新鮮，避免食用變質的皮蛋。