新鮮黃花菜未經處理直接食用可能引發中毒風險。一般情況下，新鮮黃花菜需經過正確烹飪處理後才可安全食用。
新鮮黃花菜的花蕊部位含有較高濃度的秋水仙堿，這種物質本身無毒，但在人體內會代謝為劇毒的二秋水仙堿。誤食未處理的新鮮黃花菜後，可能出現口腔灼燒感、惡心嘔吐、腹痛腹瀉等消化道症狀，嚴重者可能伴隨電解質紊亂或肝腎功能損傷。這是因為秋水仙堿會抑製細胞分裂，幹擾正常生理功能。
通過高溫焯煮和清水浸泡的處理方式能有效降低毒性。建議將新鮮黃花菜摘除花蕊後，用沸水焯燙5分鍾以上，再用清水浸泡2小時，過程中需多次換水。烹飪時需確保完全煮熟，避免涼拌或急火快炒等加工不徹底的烹飪方式。經過規範處理後，秋水仙堿含量可降至安全範圍。
日常食用應控製攝入量，成人單次食用量不宜超過50克。若誤食後出現舌頭發麻、心悸等異常反應，應立即停止食用並催吐，及時攜帶剩餘食材就醫。特殊人群如孕婦、肝腎功能不全者，建議選擇幹製黃花菜更為安全。