目前對於脂肪瘤的發病原因不明，少數病人有家族史或生後即有。多數學者認為與炎症刺激致結締組織變性，組織內纖維小梁的腺管周圍脂肪浸潤或由於組織的淋巴供應和血液循環發生障礙，導致脂肪組織沉積有關。
還有人認為脂肪瘤的發病與腦垂體前葉性腺激素的分泌有關。另外還有人認為本病的發病與先天性發育不良，全身脂肪代謝障礙以及腸營養不良所致，但證據尚不充分。
臨床上的研究通常與以下三點有關：
一、過度飲酒，經常進食肥肉、動物內髒、無鱗魚或蛋黃等人群。因為進食過多肥膩之品，高膽固醇食物，可造成脾胃濕熱，痰濕內生，運化失調，即新生脂肪組織過多，使體內過多的脂肪細胞異聚，變硬。治療原則是：解熱除濕，健脾和胃，軟堅散結。
二、工作壓力過大，心情煩躁，經常生氣的人。因為肝氣鬱結，氣血不暢，經脈不通，可造成正常的脂肪組織和淤血交織在一起，長時間可形成結締組織包裹脂肪細胞，形成脂肪瘤。治療原則：疏肝理氣，活血化瘀，軟堅散結。通過治療打通經脈，疏通經血，消散脂肪瘤。
三、經常熬夜，想問題過多的人。因為傷及脾胃，使脾失健運，陰陽失調，這樣人體對脂肪的分解能力下降，原有的脂肪組織和新生的脂肪不能正常排列，形成異常的脂肪組織，即“脂肪瘤”，治療原則：益氣健脾，調理陰陽平衡，軟堅散結。
對於脂肪瘤的發病原因目前還有待進一步研究，隻有找到了它的發病原因，才能製定出更有效的治療脂肪瘤的方法。
