子宮肌瘤需要與以下幾種疾病進行鑒別：
1、妊娠子宮：肌瘤囊性變時質地較軟，應注意與妊娠子宮相鑒別。妊娠者有停經史及早孕反應，子宮隨停經月份增大變軟，借助尿或血hCG測定、超聲檢查可確診。
2、卵巢腫瘤：多無月經改變，腫塊多呈囊性，位於子宮一側。注意實質性卵巢腫瘤與帶蒂漿膜下肌瘤鑒別，肌瘤囊性變與卵巢囊腫鑒別。注意腫塊與子宮的關係，可借助超聲檢查協助診斷，必要時腹腔鏡檢查可明確診斷。
3、子宮腺肌病：可有子宮增大，月經增多等。局限型子宮腺肌病類似子宮肌壁間肌瘤，質硬。但子宮腺肌病繼發性痛經明顯，子宮多呈均勻增大，較少超過3個月妊娠子宮大小。超聲檢查及外周CA125檢測有助於診斷。但有時兩者可以並存。
4、子宮惡性腫瘤：
（1）子宮肉瘤：好發於老年婦女，生長迅速，多有腹痛、腹部包塊及不規則陰道流血，超聲及磁共振檢查有助於鑒別，但通常術前較難明確診斷。
（2）子宮內膜癌：以絕經後陰道流血為主要症狀，好發於老年女性，子宮呈均勻增大或正常。應注意圍絕經期婦女肌瘤可合並子宮內膜癌。診刮或宮腔鏡檢查有助於鑒別。
（3）宮頸癌：有不規則陰道流血及白帶增多或不正常陰道排液等症狀，外生型較易鑒別，內生型宮頸癌應與宮頸黏膜下肌瘤鑒別。可借助於超聲檢查、宮頸脫落細胞學檢查、HPV檢測、宮頸活檢、宮頸管搔刮等鑒別。
