1. PCR-SSCP分析 是檢測mtDNA 片段序列變化或突變的一種簡單而靈敏的基因突變的篩選方法，並有不少改良的方法。對病史已明確的LHON進行mtDNA分子遺傳學檢測較易獲得陽性結果，MaeⅢ識別終點的產生提高了診斷精確度，可避免假陽性或假陰性。
2.腦脊液免疫球蛋白及細胞學檢查。
3.眼底熒光血管造影(FFA) 在急性期視盤呈強熒光，血管高度擴張，視盤黃斑束毛細血管充盈、延緩缺損等，FFA檢查可早期發現有發病可能的患者及攜帶者，因此可用於遺傳谘詢，對無症狀而有輕微血管改變者，有可能在數年後發病。
4.腦誘發電位(EPS)以及頭顱CT，MRI檢查 部分病例可發現與多發性硬化相符的情況。
5.視網膜電圖(ERG)檢查 可用於鑒別診斷。
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