安徽醫科大學第一附屬醫院是安徽省規模最大的綜合性教學醫院，集醫療、教學、科研、預防、康複、急救為一體，為安徽省緊急醫療救治基地。醫院前身為上海東南醫學院附屬東南醫院，創辦於1926年。1949年內遷至安徽懷遠縣，1952年遷至合肥市。1993年成為衛生部首批三級甲等醫院。醫院連續四年入圍中國最佳醫院80強排行榜，在中國醫學科學院《2014年度中國醫院影響力綜合排行榜》上名列第46位，位居安徽省首位。
目前，醫院開放床位2825張，設臨床科室41個，醫技科室19個，臨床教研室26個。年門診量超300萬人次，年住院病人超12萬人次，年手術4.45萬台次，年教學工作量約1.7萬學時，年接收實習生、進修醫生1000餘人。
醫院是臨床醫學一級學科科學和專業博士學位授權點，臨床醫學博士後科研流動站，碩士學位點覆蓋所有的臨床科室。擁有國家級重點學科1個，國家臨床重點專科建設項目8個，安徽省臨床重點專科建設項目15個。擁有國家重點實驗室培育基地1個，教育部重點實驗室1個，省部級共建重點實驗室1個，省級重點實驗室4個。醫院擁有“疑難重症皮膚病協同創新中心”、“神經精神疾病與心理健康協同創新中心”省級協同創新平台，學科綜合實力位列全球前1%。
醫院擁有博士生導師51人，副高職稱以上專家700餘人，博士和在讀博士200餘人，享受國務院和省政府特殊津貼120人，擔任省級以上醫學學術團體負責人60多人，有6人入選全國"百千萬人才工程"，6人被國家人事部、衛生部授予“有突出貢獻的中青年專家”，一人入選安徽省首批“外專百人計劃”，一人獲 “國家萬人計劃中組部青年拔尖人才”，1人新當選為中國醫師協會男科醫師分會副會長，省廳以上跨世紀學術技術帶頭人、骨幹教師100餘人，首屆“江淮名醫”15人，人才實力位居安徽省醫療機構第一。
醫院堅持科教興院戰略，銀屑病的遺傳學研究和紅斑狼瘡基因研究處於國際領先水平，同種異體肝髒移植、自體幹細胞移植、異體幹細胞移植、異體腎髒移植、體外循環、心髒不停跳冠脈搭橋、心腦血管介入治療、胸腔鏡和腹腔鏡微創手術、輔助生殖技術、小兒腦癱治療等專業技術水平處國內先進水平。在中西醫結合治療大麵積燒傷、微粒皮移植、眼角膜移植、人工晶體植入術等方麵積累了豐富的經驗,處省內領先地位。目前，醫院擁有安徽省首台手術機器人、PET-CT、3.0磁共振、寶石能譜CT、複合手術室、3D腹腔鏡等先進診療設備，醫療技術整體實力位居全省前列。
醫院高度重視醫學人才培養工作。醫院是國家衛計委住院醫師規範化培訓基地、國家衛計委全科醫生規範化培養基地、國家衛計委腹膜透析培訓示範中心、臨床藥師培訓基地、腦卒中篩查培訓基地、四級婦科內鏡手術培訓基地等。臨床醫學獲地方高水平大學建設計劃重點學科建設項目，省級教學團隊2個，4人獲安徽省教育名師獎。醫院每年承擔國家級和省級繼續教育項目60餘項，每年培訓近萬人，為基層醫院人才培養做出了積極貢獻。醫院充分發揮國家衛計委遠程醫學會診係統項目，與16個偏遠縣醫院實現互聯互通，方便基層群眾共享省級優質醫療資源。
近年來，醫院承擔國家863計劃和973計劃、國家科技惠民計劃、國家萬人計劃中組部青年拔尖人才基金、國家自然科學基金、安徽省自然科學基金等科研課題250餘項，獲省部級以上獎項55餘項，其中獲國家科技進步二等獎1項，教育部自然科學一等獎1項，連續兩年獲中華醫學科技一等獎，安徽省科技一等獎、二等獎、三等獎數十項。每年發表學術論文1300餘篇，其中SCI收錄論文233餘篇，主編和參編國家級規劃教材30餘部。
醫院主辦5種國內外公開發行雜誌：《肝膽外科雜誌》、《臨床骨科雜誌》、《臨床眼科雜誌》、《臨床護理雜誌》、《臨床肺科雜誌》。醫院與美國、荷蘭、德國、日本、香港等國家和地區的科學研究機構建立了密切的科研合作關係。
醫院近年來榮獲全國五一勞動獎狀、全國援外先進集體、全國青年文明號、全國百姓放心示範醫院、全國衛生係統“巾幗建功標兵”、全國城市醫院思想政治工作先進集體等多項榮譽。
