如東縣中醫院始建於1958年8月，經過五十餘年的艱苦創業，目前已成為集醫療、教學、科研於一體的的三級乙等中醫醫院，先後被評為愛嬰醫院、江蘇省高校實習基地和南京中醫藥大學教學醫院。
醫院目前占地麵積157畝，總建築麵積121630平方米，總床位1000張。現有職工638人，其中衛技人員575人，高級94人，中級152人。省名中醫1人，市名中醫5人，碩士研究生23人，全國名老中醫學術繼承工作繼承人1人，江蘇省農村優秀中醫臨床人才3名。
醫院始終以提高醫療質量和服務水平為目標，充分發揮中醫藥特色優勢。現有臨床及醫技科室39個，其中江蘇省中醫重點專科1個（肛腸科）、江蘇省基層醫療機構中醫特色專科建設項目1個（脾胃病科）、南通市中醫重點專科4個（針灸科、皮膚科、心病科、骨傷科），南通市中醫重點建設專科3個（兒科、肺病科、脾胃病科），全國基層名老中醫藥專家（陳幼清）傳承工作室建設項目1個。此外，還開設了中西醫結合治療肝病、腎病、糖尿病、乳腺病、男性病、骨質增生、小兒哮喘等13個專病門診。
近年來，醫院緊緊圍繞“弘揚醫道，精心施治，中西包容，服務眾生”的辦院理念，深化改革，強化管理，以三級乙等中醫院創建為抓手，走科技興院、人才強院、品牌立院之路，成功打造了婦科腔鏡、眼科白內障複明、眼科準分子激光、血液透析、肛腸病治療、小針刀、外科腔鏡、手足顯微外科、耳鼻喉科鼻內鏡微創、如東縣殘疾兒童康複、乳腺病防治等在全縣乃至全市都處於領先地位的特色專病專科，
醫院不僅重視發揮中醫傳統優勢，同時注重運用現代醫學的成果，適應時代的發展，滿足患者的需要。現擁有1.5T磁共振、全身螺旋CT、準分子激光治療儀、醫用數字X射線攝影係統（DR）、腔鏡及前列腺汽化設備等大中型醫療儀器設備456台套，中醫舌象采集儀、脈象采集儀、多功能艾灸儀、肛腸綜合治療儀等中醫診療設備135台套，總值6800餘萬元。
為切實貫徹“科技興院”的方針，醫院加大了對人才培養的力度，積極開展科研工作。近年來，有百餘人次被先後派往南京、上海、南通等醫院進修學習；現承擔科研課題7項，其中省級1項，市級6項。
醫院在加強物質文明建設的同時，十分注重精神文明建設並取得良好的社會效益，醫院連續四次蟬聯省“文明醫院”稱號，連續十多年被評為市、縣“文明單位”，先後獲得“全國中醫文化建設先進單位”、“江蘇省中醫藥文化示範單位”、“全國農村中醫工作先進縣先進集體”、“江蘇省衛生行風先進集體”、“江蘇省價格誠信單位”、“江蘇省宣傳思想工作先進集體”、“南通市衛生係統十佳醫院”、“南通市雙擁模範單位”等榮譽稱號。
