巴馬瑤族自治縣民族醫院創建於1995年，占地麵積約4.67畝，建築麵積為4556平方米，編製床位60張，現有編製46名，實有幹部職工92人，其中副主任醫師2人，主治醫師7人，醫師24、護士25人；開設有壯醫、針灸推拿、內、外、婦、兒、檢驗、放射、B超、手術室等15個臨床、醫技科室。做為一家公立性民族醫醫院，醫院一直重點發展壯醫科、針灸推拿科等特色科室。
建院20年來，曆屆領導班子始終堅持從醫院實際出發，一手抓醫院內涵建設，不斷強化醫療質量管理和醫德醫風建設，一手抓醫院硬件建設，不斷更新醫療設備，逐步改善就醫環境；全院幹部職工團結奮鬥，艱苦創業，勇於創新，積極進取，醫院每年的診療人數、社會效益和經濟效益等各項指標實現逐年遞增，醫院建設取得了跨越式的發展。
隨著最近幾年國家從政策上對西部貧困地區中醫藥事業的發展給予大力扶持，巴馬民族醫院一直重點扶持發展的壯醫科和針灸推拿科在2010年被列為“廣西衛生廳民族醫重點專科”。自從成立這兩個重點專科以來，醫院的中醫、民族醫診療項目的業務量逐年快速增長，這兩個專科也已經成為醫院的支柱科室。目前，醫院壯醫科和針灸推拿科在運用民族醫療法為廣大患者治病防病方麵具有顯著的療效，贏得了各界群眾的廣泛讚譽，形成了獨具特色的中醫、民族醫專科，為振興巴馬縣的中醫和壯瑤醫藥事業奠定了良好的基礎。
