北京安貞醫院成立於1984年4月，北京市心肺血管疾病研究所成立於1981年9月，北京市中西醫結合心肺血管疾病研究所成立於2014年，前兩者均由我國胸心血管外科奠基人吳英愷院士所創立，“一院兩所”為一個全方位聯合體。目前醫院占地麵積7.65萬平方米，年醫院收入50餘億元。現有職工4000餘人，高級專業技術人員750餘人，住院編製床位1,500張。設有10個臨床中心、29個臨床科室、12個醫技科室，擁有國家重點學科1個，國家臨床重點專科3個，年門急診量270萬人次，手術超過4萬例，其中心內外科手術雙雙破萬，疾病難易程度CMI值始終居於北京市醫療機構前列。多年來，醫院全體職工秉承“公勤嚴廉”的院訓，弘揚傳承吳英愷院士精神，積極承擔社會責任，致力於京津冀協同發展，出色完成應急醫療、支援西部地區、國際醫療援助等重要任務，國家衛計委授予安貞醫院援幾內亞醫療隊埃博拉出血熱疫情防控先進集體榮譽稱號，連續多次獲得首都衛生係統文明單位稱號，先後培養出全國醫藥衛生係統先進工作者、南丁格爾獎章獲得者、首都勞動獎章獲得者、首都十大健康衛士等一批優秀醫務工作者。
醫院為首批國家心血管疾病臨床醫學研究中心，擁有符合國際標準（ISBER）的國家和北京市心血管疾病臨床樣本資源庫，是首批獲得器官移植診療科目資質的醫療機構之一，心血管內、外科手術例數名列全國綜合醫院第一，國內國際影響力日益增強。近年來，圍繞優勢學科，不斷提升綜合實力，承擔中法急救與災難醫學合作中心、北京市妊娠合並心髒病轉會診中心任務，已形成以心血管病學為核心、多學科聯合發展的綜合學科群，為各類合並心髒病的患者提供優質醫療服務。 2017年度中國醫院科技影響力排行榜綜合影響力評價，安貞醫院位列第41名，心血管病學位列第2名，心血管外科位列第3名，共有12個學科進入各學科影響力的前100名。複旦大學醫院管理研究所發布2016年度中國醫院排行榜，安貞醫院排位第37名，心血管病排名第3，心外科排名第2，連續多年位居全國前列。
醫院堅持以人才為核心競爭力，作為北京市科協首批院士專家工作站，引進12位院士為特聘專家，現有“北京學者”3人，二級教授12位、長江學者2名、海聚人才9名、政府特貼專家12名、 新世紀百千萬國家級人選4名、省部級突貢專家7名、215工程領軍人才5名及學科帶頭人9名、教育部新世紀優秀人才4名 、十百千工程“十”層次人選5名及“百”層次人選20名等，每年資助優秀青年業務骨幹出國研修。醫院努力實現由規模效益型向學院型醫院轉型，是首都醫科大學第六臨床醫學院，現有首都醫科大學17個博士後流動站、17個博士研究生培養點、25個碩士研究生培養點，首都醫科大學博士研究生導師62名，碩士研究生導師135名；北京市心肺血管疾病研究所為獨立碩士研究生招生單位，現有碩士研究生導師40名。國家級診療培訓基地2個，國家臨床醫學研究中心1個,首批成為國家衛生計生委住院醫師、全科醫生規範化培訓基地，現有15個專科基地，部級重點實驗室1個，部級工程中心1個，北京市重點實驗室4個，北京市工程中心2個。連年舉辦長城五洲國際心血管病會議，搭建良好學術交流平台。
新的時期，全院職工將繼續秉承“公勤嚴廉”的院訓，團結奮鬥，努力朝著建設“三個一”，即建設“一家以治療心肺血管為特色的大型三級甲等綜合性醫院；一個國家級的區域醫療中心；一個國家心血管疾病醫學中心”的總目標邁進。
