診斷依據：根據當地流行情況，有無百日咳患者接觸史。若患兒曾有發熱，但熱退後咳嗽症狀反而加重，特別在晚間咳嗽劇烈，且無明顯肺部陽性體征，應作為疑似診斷。若有明顯痙咳，外周血計數白細胞及淋巴細胞分類均明顯增高則根據這些特點可作出百日咳臨床診斷。加之細菌培養陽性或血清學免疫學、PCR檢查陽性可以確診百日咳。
痙攣性咳嗽的鑒別診斷：
1、發作性咳嗽：發作性指間斷發生，不存在持續狀態，發作性咳嗽是一種發作形式的描述，沒有病因，所以沒有任何意義，發作性咳嗽其實大多數是過敏性咳嗽。
2、持續性咳嗽：咳嗽是呼吸係統中最常見的症狀之一，是人體的一種保護性措施，對機體是有益的,當呼吸道粘膜受到異物、炎症、分泌物或過敏性因素等刺激時，即反射性地引起咳嗽，有助於排除自外界侵入呼吸道的異物或分泌物、消除呼吸道刺激因子。持續性咳嗽是肺部疾病的前兆。這種咳嗽一旦開始就要兩三個月才能痊愈，而且任何止咳藥似乎都對它無能為力。
3、變應性咳嗽：變應性咳嗽(AC)作為一種獨立的疾病尚未得到公認.對它的界定目前還隻是處於描述性的階段,缺乏大量係統性的研究觀察.主要指臨床上某些慢性咳嗽患者,具有一些特應性的因素,抗組胺藥物及糖皮質激素治療有效,但不能診斷為哮喘、變應性鼻炎或嗜酸粒細胞性支氣管炎(EB)暫不宜歸納為其他疾病。,將此類咳嗽定義為AC.其與變應性咽喉炎、EB、感冒後咳嗽等的關係及異同有待進一步探討，以明確是否為獨立的疾病實體。
1.控製傳染源 在流行季節，凡確診的患者應立即隔離至病後40天，或隔離至痙咳後30天。對接觸者應密切觀察至少3周，若有前驅症狀應及早抗生素治療。
2.切斷傳播途徑 由於百日咳杆菌對外界抵抗力較弱，無需消毒處理，但應保持室內通風，衣物在陽光下曝曬，對痰液及口鼻分泌物則應進行消毒處理。
3.提高人群免疫力 目前已用於預防接種的百日咳菌苗有全細胞菌苗和無細胞菌苗，全細胞菌苗為常規菌苗;即百日咳、白喉、破傷風(DTP)製劑，用量每0.5ml內含百日咳4個保護單位。3～6個月嬰兒進行基礎免疫，皮下0.5，1.0，1.0ml，共3次，每次間隔4周。流行期時1個月嬰兒即可接受疫苗，1～2歲時再加強肌內注射。DTP菌苗亦有人提倡正常嬰兒和兒童2月齡進行第1次，4月齡第2次，6月齡第3次，15個月第4次，4～6歲第5次。由於年長兒或成人免疫力降低仍可感染百日咳，7歲以後每10年進行1次。該菌苗對出生時有外傷史、過敏史、家族中有精神神經病史、本人有驚厥史、進行性神經係統疾病及存在急性感染時禁忌接種百日咳菌苗。一般接種後在局部注射處有疼痛，輕度或中等度發熱等症狀，極少者在接種後數日至數周後出現驚厥等腦部症狀。國內外近年來一直在研製百日咳新菌苗，現已報道無細胞菌苗含有淋巴細胞增多促進因子(LPF)與絲狀血凝素(FHA)中單一種抗原成分或全部，其效力似乎與DTP製劑相當，已在日本、瑞士進行了現場試驗，認為該疫苗安全、有效，但須深入係列研究證實。除此外，意大利研製出新型DNA重組百日咳菌苗，目前正進行Ⅱ期試驗，認為可能為百日咳提供安全、有效菌苗。我國於1985年後對無細胞百日咳菌苗進行了係統試驗，已獲得有效的百日咳菌苗製劑。
4.藥物預防 對嬰幼兒及體弱小兒，未經預防接種而與百日咳患者密切接觸者，可選用百日咳免疫球蛋白2.5ml肌內注射，或恢複期血清10～20ml肌內注射，5～7天重複注射1次，連續3次，可使其暫不發病。近來證實紅黴素對百日咳接觸者進行預防可降低百日咳的感染率，劑量30～50mg/kg體重，分4次口服，連服5～7天，有助於控製百日咳傳播。亦有人選用複方磺胺甲噁唑，半歲內嬰兒可選用該藥乳劑5ml(含TMP40mg，SMZ200mg)，2次/d，連續7～10天。
