1.排便不盡感：肛管中有豐富的神經纖維，既有無髓鞘神經纖維。又有有髓鞘神經纖維，還有較多的神經節，形成一附屬的感覺器官。所以，在肛竇炎與肛乳頭炎初期，病人往往有排便不盡感，伴有異物嵌入肛內的感覺和下墜感等。排便不盡是肛竇炎常見的臨床症狀。
2.疼痛：疼痛是肛竇炎最常見的症狀之一。一般為撕裂痛或燒灼樣痛。撕裂痛多伴有肛門損傷或肛管表層下炎症擴散，排便時症狀加重。當外括約肌受到刺激時.肛門疼痛可加劇。由於疼痛和排便關係密切，病人懼怕排便，進一步導致便秘，加重病人的痛苦。中國醫學健康網
3.瘙癢：肛竇炎引起的肛門部瘙癢，雖不像肛門瘙癢症那樣典型，但卻難於用手抓止癢。瘙癢是由於炎症性滲出物對肛門的刺激引起的，患者肛門常較正常人潮濕。
4.反射性疼痛：肛竇炎常出現反射樣疼痛，可通過陰部內神經和第三、四骶神經向尿生殖器部反射，通過髂腹下神經和肛尾神經向骶骨和尾骨反射，或通過坐骨神經向下肢反射。它還可以引起消化道症狀，如消化不良、矢氣多或便秘等。肛竇炎可以影響整個機體的健康，被稱為直腸神經衰弱，這可能是刺激內髒和脊神經的結果。
所以要全麵的了解肛竇炎，根據以上肛竇炎的臨床症狀，給予及時的治療，以免延誤病情，以上症狀是肛竇炎常見的臨床症狀，根據不同的人也有其不同的臨床症狀。也要根據不同的人給予不同的治療。
直腸炎的症狀和痔瘡及肛竇炎等都有些相似，也會發生出血現象，伴有粘液，且有點伴有強烈的肛門直腸疼痛。患者會出現便秘與腹瀉交替，常下腹不適，經直腸鏡檢查會見黏膜水腫肥厚等。
辣椒，酒類對直腸粘膜有直接刺激作用，過度進食則會引起直腸粘膜充血，擴張;辣椒和酒類也會刺激肛門瓣及肛竇，引起局部發炎而導致肛竇炎，因此應少吃這類刺激型食物。
