1.隱性骶骨脊柱裂的合並症是發育期導致脊髓拴係損其馬尾神經。
2.脊髓脊膜膨出可合並腦積水。病兒的手術生存率，近來已達80～93%。損害部位越高，存活率越低。手術死亡病例的70%發生在術後頭兩年。死亡原因中，腦室炎占24～45%，腦積水及分流術並發症占19～30%，肺炎占22%，腎髒並發症占11%。
3. 脊髓裂或脊髓膨出極易引起腦膜炎，患兒常難以繼續生存。
4.顯性脊柱裂，可以並發雙下肢弛緩性癱瘓及大小便失禁。
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