①食物搭配不合理
如食物中含蛋白質的量較多，含碳水化合物少，食物在腸道內的發酵過程微弱，大便較幹燥。不少孩子都有偏食的毛病，喜歡吃魚肉類，不愛吃水果、蔬菜。由於食物中纖維素少，當然易便秘。人工喂養嬰幼兒，牛奶內酪蛋白及鈣質比人奶多，類便中含有多種不能溶解的鈣皂，易發生便秘。
②缺乏良好的排便習慣
兒童自幼應養成定時排便習慣，在條件反射的作用下定時排便。孩子貪玩，有意識抑製便意，時間久了，腸末稍神經對糞便刺激敏感度下降，糞便久存於直腸，水份被吸收變幹硬，當然難於排出。
③精神因素的影響
孩子受到突然精神刺激，如驚嚇，或生活環境改變等，可出現暫時的便秘現象。
④ 疾病
某些疾病可引起便秘如肛門狹窄或先天性肌無力等。
新生兒（指出生後不滿28天）便秘的原因大多為：
1.人工喂養：
牛奶經消化所含的皂鈣較多，易引起大便幹結，從而便秘。
2.乳量不足：
如果吃奶吃得少，或嘔吐較多，或進食補液的小兒可引起暫時性的無大便。另外，新生兒的消化道肌層發育尚不完全，這樣易引起便秘，還可同時伴有吐奶。隻要小兒體重不下降，嘔吐和便秘的現象都是正常的。
3.外科性疾病：
可能的畸形包括腸道閉鎖、腸狹窄、腸旋轉不良、先天性巨結腸、先天性無肛、骶尾部脊柱裂、脊膜膨出、腫瘤壓迫馬尾部神經等，這些疾病常伴有嚴重的嘔吐和腹脹的現象，需及時診治。
4.值得注意的：
新生兒幾天不大便不一定是便秘
新生兒由於解便機製未發育成熟，所以無法定時解便，常常要大便積多，直腸壁的神經感受到膨脹壓力，引發反射性的解出，這就是有些嬰兒幾天才解一次大便的原因，用溫度計刺激，因為可引發反射，所以也可以使其解便。吃母奶的小孩，由於母奶吸收較完全，大便量較少，有些嬰兒反而會好幾天才解一次便，不一定隨吃隨解。所以，新生兒幾天不大便不一定是便秘，判斷新生兒是否便秘的方法是觀察大便性狀，如果性狀正常，幾天不大便也屬正常。
5.正常新生兒的大便什麼樣：
母乳喂養的小寶寶的大便是黃色或金黃的，稠度均勻，藥膏狀，可有小顆粒，偶爾稍稀薄，可以帶少量綠色。如果奶中所含的碳水化合物較多，即我們平時所說的糖類較多，在腸道中發酵，使得大便柔軟，並且含有很多的泡沫，可以使大便的次數增多。
人工喂養的新生兒，若以牛奶喂養為主，大便為淡黃，質地可以較幹燥，可有明顯的臭味，這是因為牛奶中含有高蛋白，分解時較臭。大便中可有白色奶塊，這是因為牛奶中含大量絡蛋白，消化時易於與鈣結合形成皂鈣的緣故。
6.嬰兒（指出生未滿1歲的小兒）便秘的原因是：
1）食物中所含的纖維少：
引起大便幹結，可適當添加蔬菜類食物。
按時排便的習慣沒養成：小兒沒有養成良好的排便規律也易引起便秘，所以要每日定時訓練排便，建立一定的排便條件反射，這樣才能養成排便的好習慣。
2）精神因素：
如果小兒突然受到精神刺激，或生活環境及生活習慣突然改變也可引起短時間的便秘。此外，甲狀腺功能低下的小兒易引起便秘，但此類小兒還伴有其他表現。另外，便秘如有家族史，或家族性的腸道過長，也會造成便秘發生，這可能與遺傳有關。
⑤配方奶粉不耐受（即對配方奶粉裏的營養素消化不良）
相對於母乳，便秘和排便困難在配方奶喂養的嬰兒中更為大便幹燥常見，且多見於對普通配方奶粉中的牛奶蛋白和棕櫚油消化不好的嬰兒。這是因為：嬰兒腸道內一些消化酶分泌不足，腸道蠕動不規律，正常的腸道菌群還未建立，消化能力相對弱。母乳容易消化，而普通配方奶中的蛋白質是大分子的牛奶蛋白，比母乳難消化。另外，奶粉中的棕櫚油還會在腸道中會和鈣結合形成鈣皂，導致大便幹結，引起排便困難和便秘。
1.飲食不足
嬰兒進食太少時，消化後液體吸收餘渣少，致大便減少、變稠。奶中糖量不足時腸蠕動弱，可使大便幹燥。飲食不足時間較久引起營養不良，腹肌和腸肌張力減低，甚至萎縮，收縮力減弱，形成惡性循環，加重便秘。
2.成分不當
大便性質和食物成分關係密切。如食物中含大量蛋白質，而碳水化物不足，腸道菌群繼發改變，腸內容發酵過程少，大便易呈堿性，幹燥；如食物中含較多的碳水化物，腸道發酵菌增多，發酵作用增加，產酸多，大便易呈酸性，次數多而軟；如食入脂肪和碳水化物都高，則大便潤利。如進食大量鈣化酪蛋白，糞便中含多量不能溶解的鈣皂，糞便增多，且易便秘。碳水化物中米粉、麵粉類食品較穀類食品易於便秘。小兒偏食，許多小兒喜食肉類，少吃或不吃蔬菜，食物中纖維素太少，也易發生便秘。
3.腸道功能失常
生活不規律和缺乏按時大便的訓練，未形成排便的條件反射導致便秘很常見。另外學齡兒童常因無清晨大便的習慣，而學習時間不能隨時排便，上課時憋住大便也是導致便秘的常見原因。常用瀉劑或灌腸，缺少體力活動，或患慢性病如：營養不良、佝僂病、高鈣血症、皮肌炎、呆小病及先天性肌無力等，都因腸壁肌肉乏力、功能失常而便秘。交感神經功能失常、腹肌軟弱或麻痹也常使大便秘結。服用某些藥物可使腸蠕動減少而便秘，如抗膽堿能藥物、抗酸劑、某些抗驚厥藥、利尿劑以及鐵劑等。
4.體格生理異常
如肛門裂、肛門狹窄、先天性巨結腸、脊柱裂或腫瘤壓迫馬尾等都能引起便秘。應進行肛門指檢、下部脊柱和會陰部檢查。有的患兒生後即便秘，如有家族史，可能和遺傳有關。
5.精神因素
小兒受突然的精神刺激，或環境和生活習慣的突然改變也可引起短時間的便秘。
