由於肺部空腔樣病變見於多種疾病，需注意鑒別診斷，主要為：
1.支氣管肺癌 某些腫瘤中央組織由於血供不足可發生液化壞死形成空腔，此類病變多單發，呈偏心性，壁較厚，內壁呈結節狀或不規則，多無液平，周圍無明顯炎性浸潤。患者常有咯血，但無急性感染症狀，與肺膿腫鑒別不太困難。癌組織也可阻塞支氣管引起繼發感染，遠端形成肺膿腫，此時尤需與肺膿腫鑒別。在年齡>40歲的患者，如肺內出現孤立的空腔樣病變，尤應引起注意。痰腫瘤細胞學檢查，纖維支氣管鏡檢查，對診斷有重要價值。胸部CT可協助診斷。
2.肺結核 常有低熱、乏力、盜汗等結核中毒症狀。浸潤性肺結核或幹酪性肺炎多在上葉呈大葉實變，其中有透亮區，為無壁空洞，不伴有液平，同側或對側可有播散的斑絮狀影。痰塗片抗酸染色可發現結核杆菌。
3.肺囊腫合並感染 在X線胸片上肺囊腫表現為含液囊腫或含氣囊腫，呈圓形或卵圓形，界限清晰，含氣囊腫內有時有氣液平麵，透視下囊腫可隨呼吸改變大小。繼發感染時可有高熱、咳嗽及大量膿痰，需與肺膿腫鑒別，如原有X線胸片進行比較將易於做出診斷。
4.肺隔離症 是指由於肺髒發育畸形使部分肺組織與主體肺分離形成囊性肺塊，特別是葉內型，腫塊的支氣管可與機體的支氣管係統相通，常在局部繼發感染。臨床表現為咳嗽、咳痰、咯血及發熱等，如反複感染可出現營養不良、貧血等症狀。X線表現為囊腔周圍炎性浸潤比肺膿腫輕，多在下部，可通過主動脈造影、磁共振顯像顯示來自主動脈的異常動脈。
