一、鑒別：根據新生兒膿皰病以大膿皰隨後出現全身症狀的特點可以診斷，但要與下列疾病鑒別：
1、金葡萄性燙傷樣皮膚綜合征 可能是本病的嚴重類型，起病急，有嚴重的全身症狀，皮損主要是大水皰，尼氏征陽性，剝脫顯著，不具有大膿皰損害。
2、遺傳性大皰性表皮鬆解症 水皰多發生在手，足部等易受外傷和摩擦的部位，大皰內容澄清，常有家族史。
3、新生兒剝脫性皮炎 常發生於生後1～5周嬰兒，皮疹為彌漫性潮紅，鬆弛性大皰，擴張迅速，Nikolsky征陽性，病情發展迅速，表皮極易剝脫呈燙傷樣外觀，全身症狀危重，死亡率較高。
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