1.妊娠黃體 妊娠黃體直徑小於2cm，囊壁顆粒細胞增生，黃素化，中央無囊腔，囊壁全部卷曲成花環狀，尿HCG測定陽性等為鑒別依據。
2.囊性白體及白體囊腫，係黃體退化，囊壁無襯覆細胞為透明變性的結蒂組織，囊內仍充滿液體，即成囊性白體。直徑大於2.5cm稱白體囊腫。
3.異位妊娠 黃體囊腫破裂引發的急腹症易誤診為異位妊娠，前者HCG陰性，出血量較異位妊娠少，且無反複出血。
4.濾泡囊腫與月經周期關係密切，為排卵前的卵巢囊性增大，若發生破裂時，一般不伴陰道流血;二者之破裂與異位妊娠之破裂鑒別困難，常需根據剖腹探查發現及病理學檢查始能作出最後診斷。
5.對絕經後或生育期口服避孕藥者之卵巢增大，特別是新近發現者，應高度疑為腫瘤，必要時，進行腹腔鏡檢查或剖腹探查，以作出明確診斷。
6.黃素囊腫多見於葡萄胎或絨毛膜癌。它是由於大量絨毛膜促性腺激素刺激卵泡而引起。囊壁光滑、壁薄，很多情況下囊腔會被膈分開，成為多個小囊腔，即多房性，而且多是雙側卵巢都有。囊腫體積大小不一，大者直徑可達10～15厘米，甚至更大。囊內含清亮液體。除了由於葡萄胎或絨毛膜癌引起外，多胎妊娠、妊娠高血壓綜合征、口服大劑量雌激素及在治療不孕過程中注射絨毛膜促性腺激素時也可發生黃素囊腫。
