不同類型的特殊型子宮肌瘤具有不同的病理學特征和臨床表現，因此鑒別診斷主要依據病理學檢查和影像學檢查進行。
1.富細胞型平滑肌瘤與高分裂象平滑肌瘤：兩者均為子宮平滑肌瘤的特殊類型，但細胞形態和結構略有差異。富細胞型平滑肌瘤的細胞較豐富，核染色質少，呈波浪狀排列，而高分裂象平滑肌瘤的細胞核大，染色質多，排列為條索狀。
2.血管型平滑肌瘤：這種肌瘤的血管豐富，包膜完整，邊界清楚，但有時與子宮壁的血管難以區分。顯微鏡下可見平滑肌細胞圍繞血管呈漩渦狀排列。
3.上皮樣平滑肌瘤：這種肌瘤的細胞形態類似上皮細胞，但細胞排列為漩渦狀，包膜完整，無浸潤現象。
4.奇異型平滑肌瘤或非典型平滑肌瘤：這種肌瘤的細胞形態奇特，結構多樣，排列為片狀或條索狀，有浸潤現象。
除了病理學特征，不同類型的特殊型子宮肌瘤在影像學檢查中也有不同的表現。富細胞型平滑肌瘤和子宮腺肌病的圖像類似，都可見到子宮增大、變形等表現，但子宮腺肌病可有子宮內膜移位、形成囊腔等特征。卵巢腫瘤和子宮肉瘤的圖像也有所不同，前者為囊性腫塊，後者為實質性腫塊。
在鑒別診斷時，除了考慮病理學和影像學特征，還需要考慮患者的病史、體格檢查、實驗室檢查等多種因素。如果無法確定診斷，需要進行病理學檢查以明確診斷。
