本症應與以下疾病相鑒別
1.傷寒：發病的內因為正氣虛虧，如果身體虛弱，或勞倦饑餓 ，起居失常 ，寒溫不適 ，房事不節，均可導致正氣虛虧，易被外邪侵犯成病。1周後持續高熱，可有玫瑰疹，聽力減退，白細胞降低，嗜酸細胞消失。肥達氏反應陽性，血培養有傷寒或副傷寒杆菌生長。血清傷寒抗原及傷寒杆菌DNA檢測可資早期診斷。
2.粟粒型結核：急性粟粒型肺TB的臨床表現為發病急、高熱、寒戰、頭痛、食欲不振、嗜睡、盜汗等明顯的症狀，血培養陰性。起病2周後胸部X線攝片可見粟粒性肺結核影像。痰結核杆菌PCR檢測有助診斷。
3.變應性亞敗血症： 其臨床表現與敗血症相似，發熱可持續數月之久，但全身中毒症狀相對較輕，且可有緩解期;皮疹可反複短暫出現，反複多次血培養陰性，抗生素治療無效，腎上腺皮質激素治療有效。
4.腎綜合征出血熱：有地區性、季節性，先出現發熱，熱退後症狀反而加重，並相繼出現低血壓休克、少尿。早期呈酒醉貌，皮膚粘膜出血點，蛋白尿、血小板降低。血清特異性IgM抗體檢查可作早期診斷。
5.惡性組織細胞增多症：持續發熱，熱型不規則，常出現貧血、消瘦、白細胞減少。多次血培養陰性，抗生素治療無效。血液和骨髓塗片、淋巴結活檢可見惡性組織細胞。
6.紅斑狼瘡：起病穩匿或急驟，發作比較凶險，且極易複發，遷延不愈，出沒無常，就跟狼一樣狡猾。
