痰和支氣管肺泡灌洗液塗片和培養為最常見的檢查方法,塗片抗酸染色(Ziehl-Neelsen)陽性,但檢出率低,且不能與結核分枝杆菌作鑒別。需作培養和生化檢查如煙酸試驗、過氧化氫酶試驗和芳香硫酸酯酶活性等。
但檢驗費時,不能及早得到檢驗結果,近年有一些快速培養和菌型鑒定方法已有臨床應用。
例如BACTEC液體放射核素培養基結合核酸探針,可以顯著節省檢測時間,對常見的鳥複合分枝杆菌、堪薩斯分枝杆菌等能提供迅速、準確的診斷,但由於基因的異質性,因此對某些結核分枝杆菌檢測的敏感性不高,非結核分枝杆菌對常用抗結核藥物的耐藥發生率高,因此應作耐藥性測定。
胸部X線平片常顯示單、雙側上肺野纖維結節狀陰影,當病情進展時病灶擴大融合,且邊界模糊,並出現薄壁空洞,空洞周圍浸潤及播散病灶較少,慢性空洞呈厚壁和蜂窩狀影,兩肺下葉尖段病灶亦常見。糖尿病及其他免疫抑製者常表現為中、下野小結節狀病灶,較少見胸腔積液。
胸部CT檢查高分辨度胸部CT掃描能更清晰顯示肺部病灶,以及伴隨的多發性支氣管擴張。