對於年輕血栓患者，複發性血栓或家族好發傾向者，是否值得進行實驗室篩選，尚無統一意見，這種因為具有些此3項臨床特征的靜脈血栓患者中僅30%可查出屬ATⅢ或蛋白C或蛋白S缺乏。反之，ATⅢ或蛋白C或蛋白S缺乏者中僅13%呈現上述本項臨床特征。英國血液學會建議對年齡40～45歲靜脈血栓、複發性靜脈血栓或血栓性靜脈炎、不尋常部位的血栓、明顯血栓家族史者或反複習慣性流產者進行病因調查。低ATⅢ活性水平有診斷價值。①免疫學試驗測血漿ATⅢ抗原;②交叉免疫電泳試驗測定異常分子，在存在肝素下出現慢峰則提示ATⅢ-肝素結合部位變異;③功能試驗，包括ATⅢ肝素輔因子活性試驗和漸進性ATⅢ抑製試驗。輔因子活性試驗是本病的最佳篩選試驗，所有缺乏症均表現出異常。漸進性ATⅢ抑製試驗是基於缺乏肝素加速條件下ATⅢ的蛋由酶抑製活性與靶物蛋白酶之間的互相反應。該試驗能篩選出ATⅢ-肝素親和力受損的患者，表現為ATⅢ漸進性抑製活性正常，但肝素輔因子活性低下。
ATⅢ缺乏症分型：ATⅢ缺乏症變異型已知50餘種，分類方法尚未完善，可分為2型。
1.Ⅰ型(ATⅢ缺乏症) 屬經典型缺乏症。患者不能合成ATⅢ，故血漿ATⅢ抗原和活性都降低。Ⅰa型測不到變異蛋白，交叉免疫電泳泳動及峰形正常，但峰值減低。Ⅰb型伴少量變異蛋白，散抗原性與活性的減少不成比例，抗原水平高於活性水平。交叉免疫電泳出現慢峰。這些變異蛋白與肝素的親和力減低，和凝血酶無反應。分子病基礎Ⅰa型少數為大基因缺失或重排導致無功能等位基因。多數Ⅰ型患者為外顯子區的點狀改變，如單個堿基替代、插入或缺失，而造成：翻譯框架遷移;②過早生成終止編碼子;③產生不穩定蛋白;④影響RNA加工過程等機理參與分子病形成過程。
2.Ⅱ型(ATⅢ缺乏症) 本型血漿中半數ATⅢ為變異蛋白，故抗原量正常但活性減弱。交叉免疫電泳中見慢峰(分子量增高)，與肝素形成的複合物無活性。某些功能缺陷者的分子結構缺陷性質尚未明確。
Ⅱa型：能試驗顯示ATⅢ-肝素結合部位及ATⅢ反應部位均有異常。
Ⅱb型：僅反應部位異常。
Ⅱc型：僅肝素結合部位異常。
Ⅱa及Ⅱb型變異體都產生無功能蛋白，主要是由於單個堿基替代，使反應部位功能異常。例如ATⅢ North Wick Park Arg393→Cys。
Ⅱc的單個堿基替代使ATⅢ肝素結合部位功能異常，如ATⅢ Toyama，精47→半胱氨酸而無肝素加速，ATⅢ活性。ATⅢ Rouen-1精47→組及ATⅢ Rouen-2精47→絲使肝素親和力減低。Ⅱc型僅肝素結合部位(輔因子)活性減低者的血栓發生傾向低。
根據病情，臨床表現、症狀、體征選擇做B超、X線、CT、心電圖、血尿便常規及生化等檢查。
