1.塗片檢查
取患者尿道分泌物或宮頸分泌物，作革蘭氏染色，在多形核白細胞內找到革蘭氏陰性\n雙球菌，塗片對有大量膿性分泌物的單純淋菌性前尿道炎患者，此法陽性率在90%左右，可以初步診斷，女性宮頸分泌物中雜菌多，敏感性和特異性較差，陽性率僅為50-60%，且有假陽性，因此世界衛生組織推薦用培養法檢查女病人，慢性淋病由於分泌物中淋球菌較少，陽性率低，因此要取前列腺按摩液，以提高檢出率。\n咽部塗片發現革蘭氏陰性雙球菌不能診斷淋病，因為其他奈瑟菌屬在咽部是正常的菌群，另外對症狀不典型的塗片陽性應作進一步檢查。
2.培養檢查
淋球菌培養是診斷的重要佐證，培養法對症狀很輕或無症狀的男性，女性病人都是較敏感的方法，隻要培養陽性就可確診，在基因診斷問世以前，培養是世界衛生組織推薦的篩選淋病的唯一方法，目前國外推薦選擇培養基有改良的Thayer-Martin(TM)培養基和New York City(NYC)培養基，國內采用巧克力瓊脂或血瓊脂培養基，均含有抗生素，可選擇地抑製許多其他細菌生長，在36℃，70%濕度，含5%-10%CO2(燭缸)環境中培養，24-48小時觀察結果，培養後還需進行菌落形態，革蘭氏染色，氧化酶試驗和糖發酵試驗等鑒定，培養陽性率男性80%-95%，女性80-90%。
3.抗原檢測
1.固相酶免疫試驗(EIA)：可用來檢測臨床標本中的淋球菌抗原，在流行率很高的地區而又不能作培養或標本需長時間遠送時使用，可以在婦女人群中用來診斷淋球菌感染。\n2.直接免疫熒光試驗：通過檢測淋球菌外膜蛋白I的單克隆抗體作直接免\n疫熒光試驗，但目前在男女二性標本的敏感不高，特異性差，加之實驗人員的判斷水平，故該實驗尚不能推薦用來診斷淋球菌感染。
4.基因診斷
1.淋球菌的基因探針診斷\n淋球菌的基因探針診斷，所用的探針有：質粒DNA探針，染色體基因探針和rRNA基因探針。\n(1)質粒DNA探針\n① 隱蔽質粒DNA探針，淋球菌質粒分為三種：接合性質粒，分子最大，為36kb DNA; 耐藥性質粒包括兩個質粒，DNA長分別為5.6kb和7.1kb;隱蔽質粒4.2kb，其中隱蔽質粒存在於96%的臨床淋球菌分離株中，其它奈瑟菌不含有此質粒，故可用它的序列作為特異DNA探針檢測淋球菌，Torres采用核酸雜交技術檢測淋球菌，所用探針為隱蔽質粒，用該探針對134株淋球菌和131株相關菌株的檢測，有124株淋球菌雜交反應陽性，占93%，還可與個別其它的奈瑟菌出現交叉反應，對測定探針的敏感性實驗表明可檢出102CFU淋球菌，研究證明隱蔽質粒中CPPB基因序列在所有的淋球菌染色體中(包括不含該質粒的菌株)，因此CPPB基因探針具有良好的特異性和敏感性，Torres等用CPPB基因探針檢測了201份臨床標本， 采用非放射性地高辛標記係統， 其敏感性和特異性分別為95%和98%。\n② 耐藥性質粒DNA探針\n淋球菌的抗藥質粒可分為：\n①產青毒素酶淋球菌(PPNG)其β-內酰胺酶陽性;\n②具有高水平的質粒介導的耐四環素淋球菌(TRNG)。\nPPNG菌株是1976年首次在實驗室分離得到的，該菌中含有編碼產青毒酶的基因，該基因既可整合於染色體上也可出現在質粒DNA中，而後者居多，稱之為產青毒素酶質粒，質粒有二種，大小分別為7.4kb和5.3kb，Pescador1998年設計一特異的檢測淋球菌編碼β-內酰胺酶基因的探針，采用酶化學發光法標記，液相雜交，用測光計測是特異雜交體的光量，在4h內可檢測104-105CFU的PPNG菌株，TRNG菌株雖對四環素耐藥，但通常對β-內酰胺酶類及喹諾酮類抗菌素敏感，因此，在實驗室藥敏檢測中可歸為敏感細菌，Pescador用抗四環素淋球菌(TRNG)tetm基因的寡核苷酸探針
