該菌可引起人類多種感染。如急性中耳炎、上頜竇炎和下呼吸道感染，亦可引起腦膜炎、心內膜炎、尿道炎，嬰兒和兒童眼結膜炎、角膜炎和敗血症。近來報道MC尚可致男女性生殖泌尿道的感染如前庭大腺膿腫、男性尿道炎等。該菌產生β內酰胺酶的菌株漸多，為臨床治療帶來一定困難。中耳炎：3歲以前的兒童80%曾患有至少一次中耳炎。反複出現中耳炎的兒童常伴有語言發育延遲。采用鼓膜穿刺術對中耳炎致病因子進行多中心研究，20年間美國和歐洲有15個研究中心對穿刺得到的中耳液進行培養鑒定，得到完全一致的結論：中耳炎的主要致病菌為肺炎鏈球菌、未分型流感嗜血杆菌和MC，其中15%～20%為MC。近來采用較細菌培養更敏感的PCR方法對穿刺液進行鑒定，可能會得到更高的MC陽性率。COPD患者的下呼吸道感染：因為MC與其他奈瑟菌從革蘭染色及菌落形態上難以區別，故直到近15年來，其引起的COPD者下呼吸道感染始被重視。以下證據表明MC感染加速了COPD的進程：病情加速進展的COPD患者痰培養革蘭染色優勢菌為MC，有時甚至為MC純培養;COPD病情加速的某些患者經氣管穿刺吸痰可純培養出MC;被認為是MC感染使COPD惡化的患者應用有效的抗菌藥後病情改善;痰中有MC的COPD惡化者可檢測出對MC的特異性免疫反應。目前估計MC感染是繼未分型流感嗜血杆菌感染造成COPD病情惡化的第二位原因，30%由MC引起。COPD患者在MC感染後的臨床表現與其他細菌感染的表現沒有區別，可出現咳嗽、咳痰增加，呼吸困難加重等。痰標本革蘭染色細胞內外均可發現大量革蘭陰性的雙球菌。老年人肺炎：位於美國及歐洲的研究中心發現MC是引起相當比例的老人肺炎患者的致病菌，因為MC可寄生於呼吸道而不出現任何症狀，所以很難精確判定老人肺炎的比例，但一項前瞻性研究表明老人社區獲得性肺炎中10%由MC引起，多數感染者有基礎疾病如COPD、心髒衰竭、糖尿病等。雖然老人發生MC肺炎後病情危重，但暴發性肺炎少見。院內呼吸道感染：20世紀80年代人們即關注到MC可造成院內下呼吸道感染，已有幾起呼吸科病房暴發的報道。這些成年患者往往都有肺心病的基礎。對暴發流行的分離菌進行鑒定發現有些暴發是有多種MC菌株引起，而另一些暴發則來自同一克隆，表明MC可在人與人之間傳播。鼻竇炎：經鼻竇灌洗可得到鼻竇炎患者的標本，培養發現引起成人和兒童鼻竇炎的致病菌依次為未分型流感嗜血杆菌、肺炎鏈球菌和MC。敗血症：近來有文獻報道MC可致敗血症。MC引起的敗血症少見，可發生於任何年齡的人群中，從新生兒到老人，病情表現較大差別，從輕微症狀到危及生命。基礎疾病是決定預後的關鍵因素。在病毒感染後，MC可引起兒童細菌性氣管炎。MC還可導致兒童眼結膜炎和角膜炎，其所造成的致死性腦膜炎也有一例報道。
根據各係統的臨床表現、實驗室檢查等可判斷感染發生的部位，細菌培養到MC為確診依據，應注意有基礎疾病和免疫力低下的患者感染的臨床表現可不典型。要依賴痰菌培養生化鑒定和塗片革蘭染色，有條件者可進行分子生物學檢測。
